Las campañas de vacunación.

Gran vídeo sobre la prevención, a través de las vacunas. Aunque no sé si pienso más en la vacuna o que el niño es un demonio.

La Gripe Porcina en mapas.

El virus H1N1 se extiende de forma global. La OMS ha declarado la epidemia. Vamos a ver una serie de herramientas que nos pueden ayudar a tener una información rápida y veraz sobre lo que está ocurriendo y como avanza progresivamente.

H1N1 en Google Maps.

View H1N1 Swine Flu in a larger map

H1N1 en Wikipedia. Información de gran relevancia, es la fuente que aporta datos con mayor celeridad.

H1N1 en Twiter. CDC Atlanta, Healthmap

H1N1 en OMS. Información Oficial

H1N1 en Healthmap.

La Herencia de Medline.

Como ya he comentado en anteriores entradas, PubMed es una de las herramientas más útiles dentro de la Documentación Biomédica. Sus bases de datos aportan mucha información a nivel internacional, lo que provoca que sea una referencia de visita obligada para cualquier médico o profesional de la salud que se precie.

No obstante, tanta información, muchas veces, provoca grades cantidades de ruido y se producen grandes pérdidas de tiempo introduciendo múltiples consultas y operadores hasta obtener unos resultados que satisfagan las necesidades de información. A raíz de esto, y como ya hemos visto anteriormente, nacen unos buscadores especializados en la búsqueda en Medline.

Semedico es un buscador creado por el Laboratorio de Ingeniería del Lenguaje e información (JULIE) de la Universidad Friedrich Schiller de Jena en cooperación lel Instituto de Medicina de transfusiones, en la Escuela Médica de Hannover.

La aplicación a la hora de las búsquedas aporta un autocompletado, en la que se aportan sugerencias y sinónimos; y memoriza las anteriores consultas lo que facilita la sugerencia de términos. Ejemplo: Si estamos buscando por toxoplasmosis en el feto, la primera búsqueda con la palabra toxoplasmosis nos ofrecerá todo lo referido a esta zoonosis, pero en una segunda consulta cuando introduzcamos fetal...; una de sus primeras sugerencias será fetal toxoplasmosis.

En la interfaz de resultados nos ofrece una barra de sugerencias configurable, nos permite acotar la búsqueda sólo por artículos revisados y en algunos casos da acceso al texto completo del articulo.

Video:

Jugando con las proteinas.

Las proteínas, pequeñas y bellas estructuras que desarrollan múltiples funciones para el cuerpo humano, son unas grandes desconocidas para el público en general. Hay más de 100.000 tipos diferentes, forman cada célula, componen el sistema inmunológico y ajustan la velocidad de las reacciones químicas.

En la actualidad, se sabe la composición de muchas de ellas, pero no se sabe como doblar cada una de ellas hasta crear su estructura compleja, llena de rincones y grietas. El conocimiento de toda la proteína podría ayudar a conocer mejor nuestro organismo, y a reducir el impacto, o incluso curar algunas enfermedades como el VIH/sida, el alzheimer o el cancer.

Para su reconocimiento se están utilizando ordenadores, tanto de las compañías de investigación, como los de voluntarios externos. En el 2005, se crea un programa llamado Rosetta@home, que utiliza el potencial de procesamiento de los ordenadores personales de los voluntarios. A día de hoy llegan a las 200.000 personas, pero que se demuestran insuficientes. Como dice su creador, David Baker, "Los ordenadores trabajan bien sobre pequeñas proteínas, sin embargo en proteínas más complejas, en las que su estructura se hace grande y más grande, los ordenadores quedan obsoletos"

Ante tal vicisitud, se creo el proyecto Fold it. Se trata de buscar la vinculación del usuario del PC al proyecto. Usando la intuición y la deducción del propio usuario; (En mi caso el sistema prueba-fallo; prueba-fallo; prueba-acierto) se consigue una mayor velocidad para la comprensión de las estructuras de las proteínas. Según sus autores, hay adolescentes de 13 años que muestran más pericia que doctores especializados en la materia.




En un futuro, se pretende implementar dentro del programa, el desarrollo de estructuras complejas de proteínas que ayuden al medio ambiente, a neutralizar virus como el VIH o a curar enfermedades como el Alzheimer.

Está disponible en las tres plataformas (Windows, Linux, Mac) y permite jugar en modo red. Al final los jugadores con mayores puntuaciones, es decir que hayan descubierto, o creado un mayor número de proteínas aparecerán en los artículos que publique el grupo investigador.

Aquí os dejo un pequeño tutorial, para que comprendaís como se utiliza.



Enlace: Fold.it

Nextbio. Mejor rendimiento y facilidad de búsqueda

No hace mucho que salió este recurso, pero muestra grandes mejoras frente a otros recursos de carácter más estáticos. Con la llegada de Google se favorecieron unos nuevos diseños más minimalistas, y que fueran más interactivos y más fáciles de usar que sus predecesores como Medline.

Aunque, a priori dichas bases de datos nunca van a desaparecer, ya que el volumen de información tratado, el valor económico invertido en ellas, pero sobre todo su fiabilidad las convierten en herramientas base. Es decir, los nuevos productos que salen al mercado de la nueva web 2.0 se apoyan directamente sobre estos. Son su fuente y en ellas descansa el peso de estos nuevos buscadores, sin mucha publicidad en el mercado.

Un ejemplo de ellos es Nextbio. Es un potente buscador que permite a los investigadores acceso al mundo de información en las ciencias de la salud de manera totalmente gratuita [Se financia con publicidad]. Las búsquedas permiten gran precisión y de una manera fácil e intuitiva. [Es la época de los buscadores de la generación Google]. Además aporta una red social, donde poder integrarse en comunidades de investigación, subir las propias investigaciones y proyectos y encontrar información sobre los denominados "Colegios invisibles".

Los contenidos están basados fundamentalmente en los resultados de diversas bases de datos, sobre todo Medline. Lo que le permite tener un gran acceso gratuito a una multitud de documentos.

El buscador permite búsquedas a través de genética, tejidos, componentes o fármacos y patologías en unas 18 millones de publicaciones científicas del área de salud, y unos 56000 ensayos clínicos. Todas ellas analizadas a través de ontologias, vocabulario controlado, sinónimos y términos relacionados, que permiten hacer búsquedas estructuradas con mayor facilidad.

Realizando una búsqueda:

El cuadro de búsqueda, al poner cualquier palabra nos ofrece una serie de posibilidades basadas en la ontologia que hemos comentado antes.

Una vez realizada la búsqueda, en nuestro caso Chagas [Captura]. En primer lugar nos ofrece una referencia sobre la Enfermedad de Chagas. Dentro de la explicación algunas palabras están en mayúsculas los que no puede ayudar a encontrar otros descriptores afines. En el lado derecho, debajo de las pestañas, se nos ofrece la posibilidad de crear un filtro que mejore nuestros resultados.

Los resultados se dividen en experimentos , que ofrecen estadísticas sobre el origen de los datos, y sobre que organismos se han realizado; literatura científica ofreciendo una nube de etiquetas [A destacar los primeros resultados son de revistas con alto factor de impacto como Nature o Cell]. La mayoría de las veces, para el acceso completo a la revista se necesita la conexión a través de un distribuidos como Science direct, ebsco... En estos casos el cuadradito de Full Acces aparece en gris [captura], si el artículo esta completo de forma gratuita aparecerá en verde[captura].

También disponemos de ensayos clínicos y noticias aparecidas en periódicos especializados.

La comunidad.

La comunidad funciona como cualquier red social, ofreciendo los artículos de cada uno de los usuarios. Es una buena forma de intercambiar opiniones, colaborar y recibir información sobre colegas que están trabajando en la misma línea de investigación.