NextBio y NovoSeeK se renuevan.

Éste es un blog con poco tiempo, sólo hace falta ver la cantidad, calidady frecuencia de actualización del mismo, peor de lo que uno esperaba. No dispongo de mucho tiempo, pero como decía San Isidro "Aré lo que pudé".

No obstante, siempre es una sorpresa agradable encontrarse que las herramientas que aqui se citan, se renuevan y mejoran, dando una mayor fiabilidad a estos nuevos buscadores médicos. Son casos como el de NextBio -Empresa Californiana- y NovoSeek -Empresa Española-.

NextBio ha renovado su interfaz [captura] abandonando su simplicidad, para favorecer de manera clara, la imagen de la compañia que hay tras el buscador. Gracias a ello, podemos observar que la compañia además del servicio básico nos ofrece un servicio profesional y otro para compañias, además de extenderse a otras plataformas como el Iphone o establecer puestos de trabajo con todo lo relativo al buscador.

También se ha renovado la interfaz de resultados [captura], en mi opinión mucho más complicada que la anterior.

En cuanto a NovoSeek ha realizado un cambio mucho más profundo dentro de su buscador, y es que a partir de ahora permite realizar búsquedas sobre texto completo (En realidad, lo que se produce es un proceso de Mineria de datos sobre los artículos, extrayendo todo aquello que se pueda considerar relevante.) en revistas open- access.

Además, aunque esto ya se pedía desde hace tiempo, se han incluído dentro del buscador los contenidos existentes en PubMed Central. Es decir, extienden su buscador sobre 140.000 nuevas referencias, y añaden otras 1000 referencias diarias.

En conclusión, se añaden al buscador nuevas referencias en las que se puede buscar a texto completo, mejorando de forma notable los resultados.

Fuentes. [1], [2]

Novo|seek. Un nuevo buscador biomédico.

Novo|seek es uno de los mejores productos que por ahora he probado. Más allá de sus características que más tarde mencionare, tienen una gran capacidad de innovación y aunque su refinamiento de búsquedas todavía no lo considere completo, están trabajando muy bien dentro del proyecto.

Este buscador nace como carta de presentación de la empresa Bioalma. Primera empresa española que dedica todo su potencial en exclusiva al desarrollo de biotecnología vinculada a la documentación biomédica.

Novo|seek, a pesar de su interfaz en inglés, apoyándose en Medline sería una paradoja entre resultados y página (Relación contenido y contienente que me enseñaron a mí en bachillerato) permite realizar búsquedas a partir de 3 millones de conceptos médicos, recuperar a través de los mismos, aunque estén insertos; resaltar los conceptos claves de la búsqueda dentro del resumen del documento, filtrar la búsqueda (De manera fácil, pero a veces insuficiente). la posibilidad de búsqueda avanzada (Siempre se agradece), múltiples vistas en los resultados de la consulta. La realización de una búsqueda se puede ver en el sigueinte video:

Los filtros se añaden de forma muy fácil, estos son creados a partir de los resultados de la búsqueda lo que genera un alto grado de afinidad con la búsqueda y la consiguiente facilidad de adicción. Si necesitáramos establecer una relación booleana entre dos términos menos afines recurriríamos a la búsqueda avanzada que ya comente antes. (Quien iba a decir hace 80 años que el chagas estaba relacionado , en cierta manera, con los síncopes cardiacos ¿verdad?). Ejemplo de Búsqueda avanzada

Los resultados de la búsqueda se ordenan por fecha o relevancia ( La relevancia se adquiere según el número de veces que aparece el concepto buscado en el resumen del artículo.)

Realizando una búsqueda:

Nuestro investigación se realiza sobre una paciente embarazada con VIH Realizamos una búsqueda sobre Toxoplasmosis y VIH y nos ofrece 1300 resultados que se pueden ir filtrando a partir de la barra lateral, en unos 35 segundos hemos filtrado la búsqueda hasta 4 resultados. Tres de ellos a texto completo.

En cuanto al aspecto empresarial del proyecto, por ahora según parece están sufragando gastos con publicidad de adsense, aunque en un futuro no duda en ofrecer una versión profesional del mismo.

Como sugerencia, yo añadiría la capacidad de buscar por grupos de investigación o entidades y, sobre el orden de presentación de los resultados, no puedo aportar nuevas ideas, pero los sistemas estadísticos nunca me han llegado ha convencer, aunque sepa de su utilidad.

La Herencia de Medline.

Como ya he comentado en anteriores entradas, PubMed es una de las herramientas más útiles dentro de la Documentación Biomédica. Sus bases de datos aportan mucha información a nivel internacional, lo que provoca que sea una referencia de visita obligada para cualquier médico o profesional de la salud que se precie.

No obstante, tanta información, muchas veces, provoca grades cantidades de ruido y se producen grandes pérdidas de tiempo introduciendo múltiples consultas y operadores hasta obtener unos resultados que satisfagan las necesidades de información. A raíz de esto, y como ya hemos visto anteriormente, nacen unos buscadores especializados en la búsqueda en Medline.

Semedico es un buscador creado por el Laboratorio de Ingeniería del Lenguaje e información (JULIE) de la Universidad Friedrich Schiller de Jena en cooperación lel Instituto de Medicina de transfusiones, en la Escuela Médica de Hannover.

La aplicación a la hora de las búsquedas aporta un autocompletado, en la que se aportan sugerencias y sinónimos; y memoriza las anteriores consultas lo que facilita la sugerencia de términos. Ejemplo: Si estamos buscando por toxoplasmosis en el feto, la primera búsqueda con la palabra toxoplasmosis nos ofrecerá todo lo referido a esta zoonosis, pero en una segunda consulta cuando introduzcamos fetal...; una de sus primeras sugerencias será fetal toxoplasmosis.

En la interfaz de resultados nos ofrece una barra de sugerencias configurable, nos permite acotar la búsqueda sólo por artículos revisados y en algunos casos da acceso al texto completo del articulo.

Video:

Nextbio. Mejor rendimiento y facilidad de búsqueda

No hace mucho que salió este recurso, pero muestra grandes mejoras frente a otros recursos de carácter más estáticos. Con la llegada de Google se favorecieron unos nuevos diseños más minimalistas, y que fueran más interactivos y más fáciles de usar que sus predecesores como Medline.

Aunque, a priori dichas bases de datos nunca van a desaparecer, ya que el volumen de información tratado, el valor económico invertido en ellas, pero sobre todo su fiabilidad las convierten en herramientas base. Es decir, los nuevos productos que salen al mercado de la nueva web 2.0 se apoyan directamente sobre estos. Son su fuente y en ellas descansa el peso de estos nuevos buscadores, sin mucha publicidad en el mercado.

Un ejemplo de ellos es Nextbio. Es un potente buscador que permite a los investigadores acceso al mundo de información en las ciencias de la salud de manera totalmente gratuita [Se financia con publicidad]. Las búsquedas permiten gran precisión y de una manera fácil e intuitiva. [Es la época de los buscadores de la generación Google]. Además aporta una red social, donde poder integrarse en comunidades de investigación, subir las propias investigaciones y proyectos y encontrar información sobre los denominados "Colegios invisibles".

Los contenidos están basados fundamentalmente en los resultados de diversas bases de datos, sobre todo Medline. Lo que le permite tener un gran acceso gratuito a una multitud de documentos.

El buscador permite búsquedas a través de genética, tejidos, componentes o fármacos y patologías en unas 18 millones de publicaciones científicas del área de salud, y unos 56000 ensayos clínicos. Todas ellas analizadas a través de ontologias, vocabulario controlado, sinónimos y términos relacionados, que permiten hacer búsquedas estructuradas con mayor facilidad.

Realizando una búsqueda:

El cuadro de búsqueda, al poner cualquier palabra nos ofrece una serie de posibilidades basadas en la ontologia que hemos comentado antes.

Una vez realizada la búsqueda, en nuestro caso Chagas [Captura]. En primer lugar nos ofrece una referencia sobre la Enfermedad de Chagas. Dentro de la explicación algunas palabras están en mayúsculas los que no puede ayudar a encontrar otros descriptores afines. En el lado derecho, debajo de las pestañas, se nos ofrece la posibilidad de crear un filtro que mejore nuestros resultados.

Los resultados se dividen en experimentos , que ofrecen estadísticas sobre el origen de los datos, y sobre que organismos se han realizado; literatura científica ofreciendo una nube de etiquetas [A destacar los primeros resultados son de revistas con alto factor de impacto como Nature o Cell]. La mayoría de las veces, para el acceso completo a la revista se necesita la conexión a través de un distribuidos como Science direct, ebsco... En estos casos el cuadradito de Full Acces aparece en gris [captura], si el artículo esta completo de forma gratuita aparecerá en verde[captura].

También disponemos de ensayos clínicos y noticias aparecidas en periódicos especializados.

La comunidad.

La comunidad funciona como cualquier red social, ofreciendo los artículos de cada uno de los usuarios. Es una buena forma de intercambiar opiniones, colaborar y recibir información sobre colegas que están trabajando en la misma línea de investigación.

Youmedic, un "Buscador para el paciente"

A raíz del último post, tuve conocimiento de un nuevo buscador, de iniciativa española, que busca recursos sobre medicina, farmacia y ciencias afines, denominado por los autores como Youmedic, aprovechando el tirón que tiene ahora mismo las palabras relacionadas con el archiconocido youtube.

En la actualidad, se encuentra todavía en fase Beta, y según parece tiene mucho que prometer. Los resultados por ahora están más dirigidos hacia el público general, que hacia el profesional. Proporciona grandes cantidades de información sobre las enfermedades más comúnes, pero tiene ligeras deficiencias a la hora de dar información actualizada que aporte utilidad de forma clara al profesional médico. Es decir, como buscador de consulta de datos comunes o información sobre una enfermedad común los resultados son positivos, pero para ensayos clínicos, trabajos de investigación o avances en determinados campos no se declara demasiado útil.

Una gran idea, es aportar el conocimiento colectivo de la comunidad de pacientes, a través de los foros. La información que nos provee debe ser evaluada y constrastada conciendamente, antes de su análisis, sin embargo aporta un gran conocimiento sobre el desarrollo de las enfermedades a través de los pacientes, los cuales, cuando las enfermedades son crónicas llegan a albergar más conocimiento que el propio profesional. Un ejemplo son proyectos como Health 2.0 o alguno de los proyectos que se detallan en Sanidad 2.0

El sistema se basa en la búsqueda personalizada de Google, del que obtiene los resultados, de forma más precisa y sin producir tanto ruido como el famoso buscador, ya que focaliza la búsqueda sólo sobre determinadas páginas. Esto hace que algunas páginas se conviertan casi en un monopolio en los resultados del buscador como pasa con Medline Plus.

Además, se ha añadido una busqueda para fármacos. También de carácter general, no aporta información sobre ensayos, estadísticas o estudios sobre los mismos. Por lo que he probado, sólo se obtienen resultados sobre prospectos (Al utilizar nombres comerciales),[Captura] referencias a Medline Plus (Principio Activo) [Captura]

En cuanto, a la publicidad del buscador, basada en Adsense de Google sólo puedo decir que me parece exagerada, y que atenta contra la seguridad del paciente en algunos casos.